As Infestações são locais onde os frenéticos constroem seus ninhos para hibernar durante o dia. Sempre que você passar perto de uma infestação, Deacon fará comentários sobre o cheiro ou mencionará a necessidade de voltar para queimar os ninhos. Esses locais são indicados por marcadores vermelhos com o símbolo de material infectado. Existem 13 infestações no total, e cada uma delas contém de 3 a 6 ninhos.